Die FES Lindach möchte in erster Linie christlich prägen, d. h. für Christus, aber nicht für eine bestimmte Kirche werben. Deshalb steht sie als Freie Evangelische Bekenntnisschule grundsätzlich allen Schülerinnen und Schülern offen, deren Erziehungsberechtigte sich mit den Zielen der internen Schulordnung und dem Konzept der Schule einverstanden erklären. Als Bekenntnisschule vertritt die Schule das Bekenntnis der Evangelischen Landeskirche Württemberg. Die Aufnahme erfolgt in Abstimmung mit dem Kuratorium. Die rechtliche Grundlage bildet der Schulvertrag.